马可福音很难提炼出一个令人满意的大纲。该书内容大体是一系列事件的记录，但这些事件未必是按照时间关系一件接一件地发生。然而，以地理顺序为依据的大致结构却比较明显。因此，我们会把马可福音引言之后的主体内容按地理位置分段——加利利，加利利及邻近地区，前往耶路撒冷的旅程，以及耶路撒冷。
马可福音的主题可以表述为“耶和华的仆人”。
一、仆人的到来（1:1-13）
（一）本书标题（1:1）
（二）施洗约翰的事工（1:2-8）
（三）耶稣受洗（1:9-11）
（四）耶稣受撒但试探（1:12-13）
二、仆人的事工（1:14-13:37）
（一）加利利的事工（1:14-4:34）
1. 对耶稣传道的概述（1:14-15）
2. 呼召四位渔夫（1:16-20）
3. 迦百农的事工（1:21-34）
（1）会堂中的骚动（21-28节）
（2）医治彼得的岳母（29-31节）
（3）天晚日落时的医治事工（32-34节）
4. 在加利利的旅行（1:35-45）
（1）离开迦百农（35-39节）
（2）洁净大麻风病人（40-45节）
5.与文士的冲突（2:1-3:6）
（1）瘫子得到赦免和医治（2:1-12）
（2）利未蒙召并摆设宴席（2:13-17）
（3）关于禁食的问题（2:18-22）
（4）关于守安息日的争论（2:23-3:6）
①在安息日掐麦穗（2:23-28）
②治好手萎缩的人（3:1-6）
6. 服侍众人（3:7-12）
7. 设立十二门徒（3:13-19上）
8. 对耶稣的反对逐渐增加（3:19下-35）
（1）他朋友们的担心（19节下-21节）
（2）勾结别西卜的控告（22-30节）
（3）他真正亲属的身份（31-35节）
9. 给众人的比喻性教导（4:1-34）
（1）教导的背景（1-2节）
（2）教导的内容（3-32节）
①撒种的比喻（3-20节）
②听众的责任（21-25节）
③种子生长的比喻（26-29节）
④芥菜种的比喻（30-32节）
（3）寓言段落的总结（33-34节）
（二）撤离加利利（4:35-9:50）
1. 第一次撤离和返回（4:35-6:29）
（1）平息风浪（4:35-41）
（2）治愈格拉森鬼附的人（5:1-20）
（3）回去路上的两件神迹（5:21-43）
①睚鲁的请求（21-24节）
②患血漏症的女人（25-34节）
③使睚鲁的女儿复活（35-43节）
（4）耶稣在拿撒勒被拒绝（6:1-6）
（5）十二门徒的使命（6:7-13）
（6）希律对关于耶稣报告的反应（6:14-29）
①希律·安提帕兴奋的反应（14-16节）
②对施洗约翰之死的解释性记录（17-29节）
2. 第二次撤离和返回（6:30-7:23）
（1）喂饱五千人（6:30-44）
（2）在水面上行走（6:45-52）
（3）在人群中的医治事工（6:53-56）
（4）关于不洁净的论战（7:1-23）
①谴责人为的传统（1-13节）
②真正不洁净的源头（14-23节）
3. 第三次撤离和返回（7:24-8:13）
（1）叙利腓尼基妇人的祈求（7:24-30）
（2）治愈耳聋舌结之人（7:31-37）
（3）喂饱四千人（8:1-10）
（4）要求从天而来的神迹（8:11-13）
4. 第四次撤离和返回（8:14-9:50）
（1）关于酵的警告（8:14-21）
（2）伯赛大的盲人（8:22-26）
（3）彼得的认信（8:27-30）
（4）关于十字架的宣告（8:31-9:1）
①预言将要到来的受难（8:31-32上）
②责备彼得（8:32下-33）
③背十字架的教导（8:34-9:1）
（5）登山变相（9:2-8）
（6）关于以利亚的讨论（9:9-13）
（7）医治被鬼附的男孩（9:14-29）
（8）再次教导十字架受难（9:30-32）
（9）在迦百农教导门徒（9:33-50）
①谁为大的问题（33-37节）
②约翰错误的热心（38-41节）
③罪的严重性（42-50节）
（三）前往耶路撒冷的旅程（10:1-52）
1. 离开加利利（1节）
2. 关于离婚的教导（2-12节）
3. 为小孩子祝福（13-16节）
4. 关于永生的问题（17-22节）
5. 关于钱财与奖赏的讨论（23-31节）
6. 第三次宣告将来的受难（32-34节）
7. 关于门徒中各人的地位问题（35-45节）
（1）雅各和约翰的请求（35-40节）
（2）对十二门徒的教导（41-45节）
8. 医治耶利哥城的乞丐（46-52节）
（四）在耶路撒冷的事工（11:1-13:37）
1. 预备性事件（11:1-26）
（1）以弥赛亚身份进入耶路撒冷（1-11节）
（2）咒诅无花果树（12-14节）
（3）洁净圣殿（15-19节）
（4）从枯萎的无花果树引出的教训（20-25节）
2. 在耶路撒冷的公开教导（11:27-12:44）
（1）敌人的提问（11:27-12:34）
①关于权柄的问题（11:27-12:12）
A. 耶稣让提问者无言以对（11:27-33）
B. 耶稣让提问者的面目暴露出来（12:1-12）
②关于纳税的问题（12:13-17）
③关于复活的问题（12:18-27）
④关于最大诫命的问题（12:28-34）
（2）耶稣的反击（12:35-40）
①关于弥赛亚儿子身份的问题（35-37节）
②对文士的定罪（38-40节）
（3）表彰寡妇的奉献（12:41-44）
3. 给门徒讲论末世（13:1-37）
（1）对圣殿的预言（1-2节）
（2）四位门徒的提问（3-4节）
（3）对门徒的预言性回答（5-37节）
①给门徒的警告（5-13节）
A.这个时代的特征所造成的危险（5-8节）
B. 在逼迫中的个人危险（9-13节）
②末日和基督再临之征兆（14-27节）
A. 末日危机（14-23节）
B. 人子再临（24-27节）
③最后的教导（28-37节）
A. 从无花果树引出的教训（28-29节）
B. 成就的日期（30-32节）
C. 警醒的必要（33-37节）
三、仆人的自我牺牲（14:1-15:47）
（一）耶稣的敌人和朋友（14:1-11）
1. 犹太公会的密谋（1-2节）
2. 在伯大尼受膏（3-9节）
3. 犹大的背叛（10-11节）
（二）守逾越节（14:12-25）
1. 预备逾越节晚餐（12-16节）
2. 耶稣宣布自己会被出卖（17-21节）
3. 有关圣餐的指示（22-25节）
（三）客西马尼园（14:26-52）
1. 在前往园子路上的启示（26-31节）
2. 在园中的痛苦（32-42节）
3. 被卖和被捕（43-50节）
4. 逃跑的少年人（51-52节）
（四）耶稣受审（14:53-15:20上）
1. 在犹太公会前“受审”（14:53-65）
2. 彼得三次不认主（14:66-72）
3. 在彼拉多面前受审（15:1-15）
4. 兵丁的戏弄（15:16-20上）
（五）钉十字架的记述（15:20下-41）
1. 去往各各他之路（20节下-22节）
2. 钉十字架与最初的三个小时（23-32节）
3. 最后三个小时和耶稣的死亡（33-39节）
4.远远观望的妇人（40-41节）
（六）尸体被安葬（15:42-47）
四、仆人的复活（16:1-20）
（一）妇人们来到空坟墓前（1-8节）
（二）马可福音加长的结尾（9-20节）
1. 耶稣的显现（9-14节）
2. 给门徒的使命（15-18节）
3. 主耶稣升天（19-20节）
